南方稻田和棉地冬种马铃薯一般在元月中下旬播种，每亩用种量100公斤左右，满垄栽培，栽9000蔸左右。为了保证冬种马铃薯获得高产，切实提前做好病虫害的预防工作是一项不可忽视的工作，主要要求做好以下几个方面的工作。
种植地块和品种的选用。注意良好的土壤环境，马铃薯的许多病虫害是土壤可以传播的，如青枯病、晚疫病、癌肿病、疮痂病、线虫、地老虎、金针虫等。选择良好的土壤环境种植马铃薯，可以有效地避免和减少病虫害的发生。在生产实践中，应选择排灌条件良好的沙壤土或壤土中栽培，晚稻田或旱坡地，对前作有一定要求，前作最好不应种植烟草、辣椒、茄子等茄科作物。播种前进行深耕翻耙。根据土壤地势和水分条件情况作厢，地势高排水条件良好的可以做成宽厢，尽量避免在地势低、排水不良的田块种植，若在此类地块种植马铃薯，则必须作窄厢或高厢。注意搞好栽培土壤的消毒，一般中性或微碱性土壤容易发生病害，因此，一方面要对土壤进行深翻晒垡，并增施腐熟有机肥，另一方面要进行水旱轮作，或与其他豆科、葫芦科、百合科作物倒茬，在起垄后用53.8%可杀得2500倍液喷洒种植沟内，可减少土壤病原菌数量，降低以后的发病率。在品种选用上，应选择对病虫抗性好的马铃薯品种，如抗晚疫病、病毒病和疮痂病等抗性强的品种。目前栽培的这些品种有费乌瑞坨、克新1号、合作88、东农303、云薯506、兴佳2号、丽薯6号等。
选用无病的脱毒种薯。在满足产量、品质、市场前景的前提下，选用无病抗毒的品种。种薯是许多病害的传播来源，如退化的种薯最易造成病毒病的传播和积累，同时又是晚疫病和青枯病等病害的侵染来源，带病种薯还可能是块茎蛾、金针虫、线虫等的传播源。需要注意的是带有细菌性病害的种薯可以通过切片进行大面积的扩散传播，因此，选用健康的脱毒的种薯是马铃薯病虫害综合防治的基础和关键。除了上述情况外，在选用种薯时还要看种薯色泽是否艳丽、芽眼是否明显，不能选用病烂薯和畸形马铃薯种薯，避免产生伤口，减少病菌感染的概率。播种前对种薯进行催芽，凡是从北方调入的品种，一般均没有结束休眠期，为使其出苗快、齐、壮，必须进行催芽、炼芽处理。方法是将种薯按其芽眼切块，顶部和基部分别放置（因两者发芽有先后），然后用0.05%的高锰酸钾溶液浸1-2小时，取出凉一夜，再分层置于湿润的河沙上，宽60厘米，长不限，放一层切块，铺一层河沙（厚1厘米），可堆放4-5层，外盖稻草，一般经10-15天，便可发芽。然后将发芽的种薯取出，未发芽的继续催芽，并置于暖和的阳光下晒2-3天进行炼芽，使芽基部节密，增加匍匐茎数，待芽长1-2厘米时即可种植。催芽时，若发现腐烂薯块要及时清除，河沙要保持湿润。
种薯的消毒灭菌。种薯买回后，立即分散储藏，将种薯置于室内干燥，阴凉通风处均匀摊开，严格挑选出病烂薯。有条件的可适当晒种薯1-2天。每天2-3小时，然后用多菌灵600-800倍液喷雾消毒。常用的方法是：1.草木灰拌种。将切好的薯块用温水洗净，然后用新鲜草木灰拌种，使薯块伤口均匀地粘上草木灰，并立即播种，能有效地防治黑胫病、环腐病等，防止种薯腐烂。2.石灰水或高锰酸钾液消毒。薯块用1%石灰水或1%高锰酸钾液浸种消毒10分钟后，捞取种薯平摊晾干再播种，可预防黑胫病、疮痂病。3.多菌灵、百菌清消毒。切块后的种薯用多菌灵、百菌清和双灰粉按1:1:50的比例拌种，形成保护膜；或用1公斤双灰粉加20克甲基托布津加20克多菌灵加1克新植霉素拌种，防病效果好。4.药剂处理。切刀的消毒，切刀不消毒容易导致块茎病虫的蔓延，因此，必须重视切刀的消毒处理。具体方法是：切种薯时要准备3把刀，将刀放入5%高锰酸钾溶液中浸泡1-2分钟，在正常情况下，每隔30分钟左右换1把，如切对病烂薯，要立即更换切刀，防止烂薯病原交叉感染。注意集中处理病烂薯。5.其他药剂处理。用50毫克硫酸铜对水1公斤浸泡种薯块10分钟，可预防黑胫病、环腐病。用40%福尔马林200倍液浸种20-30分钟，或将种薯浸湿，再用塑料薄膜盖严闷种2小时，晾干后播种，可防治疮痂病、粉痂病。用0.5%硫酸铜液浸泡2小时，或在播种前用50%多菌灵可湿性粉剂浸种15-20分钟，可防治立枯丝核菌病。或用20%盐酸溶液浸种5分钟，能防治疮痂病等。或用25%甲霜灵悬浮种衣剂按100-125克对水稀释成10公斤后处理10公斤种薯，拌种或浸种15分钟，能预防马铃薯晚疫病。凡是地下害虫危害严重的地块，应配合选用48%噻虫胺种子处理悬浮剂60-80毫升／100公斤种薯进行拌种。用50毫升5%阿维菌素乳油加100克50%克菌丹可湿性粉剂加100克77%硫酸铜钙可湿性粉剂，对水50毫升拌种100公斤马铃薯种薯；或将荧光假单孢菌和解淀粉芽孢杆菌按2:1复配后，与马铃薯种薯拌匀，也可以用3%氨基寡糖素50倍液或47%春雷霉素。王铜可湿性粉剂喷洒种薯晾干后播种，防治疮痂病效果显著。6.药剂处理土壤防地下害虫。可选用2%氟氯氰。噻虫胺颗粒剂，在马铃薯播种时，按照每亩1.5-2公斤用药量，对细土30公斤，混匀后施于播种沟内覆土。或选用0.5%噻虫胺，按每亩12-15公斤，在马铃薯播种时均匀撒施或沟施，以杀灭地下害虫。
