近期，巴西棉花作物中的线虫数量反弹性增加，引起种植户的重视。巴西当前最严重的疫病区为马托格罗索州和巴伊亚州西部，估测产量损失高达40%。

　　巴西农业研究公司Embrapa Algod??o对马托格罗索州进行的调查显示，近23%的区域受一种极有侵害性和快速扩散的线虫——根结线虫(Meloidogyne incognita)的影响。

　　Embrapa研究员Nelson Suassuna称，害虫寄生在根部，减缓花朵和果实的生长并降低数量。普通肾形线虫(Rotylenchulus reniformis)和短尾短体线虫(Pratylenchus brachyurus)出现在塞拉多，危害性较低，但值得引起关注。

　　根据2011/2012年和2012/2013年种植季的数据，短尾短体线虫出现数量更多，空间分布更广，在马托格罗索州超过9%的抽检地区发现了该类害虫。23%的抽检地区发现了根结线虫，多数集中在东中部、北中部和北部，较少地出现在东北部大多数地区。10%的抽检地区发现了普通肾形线虫，南部地区出现较多，中部和北部地区适中。在接近15%的抽检地区发现了大豆胞囊线虫(Heterodera glycines)，多数集中在中北部和西北部。由于该种线虫并非棉花作物的致病害虫，只在种植大豆后的大部分棉花种植区的土壤样本中被发现。