在现在的农业种植中，有机肥料在陆上种植中的好处多多，水田种植农作物同样的原理，甚或水田更适宜施用有机肥料。施用有机肥后，在微生物的作用下，一方面矿质化为作物吸收的营养元素，另一方面腐殖化为腐殖质，改善土壤的物理性状，调节土壤水、肥、气、热状况，使土壤疏松易耕，变瘦土为肥土，变坏土为好土。所以说稻田巧施有机肥更高产。

　　稻田连年种植，每年不但要从土壤中吸收走大量的氮、磷、钾三要素和一定量的钙、镁、硫、铁等元素，而且还要吸收少量的氯、锌、锰、硼、铜、钼等微量元素，大约为氮的10倍，大量的多种营养元素被吸收，还有一部分被淋溶损失，仅靠无机肥料补充远远不能满足水稻生产需要。必须实行有机肥料和无机肥料配合施用。

　　施用有机肥料，不仅可直接为水稻提供各种丰富的养分，而且还能在土壤微生物对有机物质的分解过程中，使一部分有机质起腐殖化作用，合成土壤腐殖质，这对改善土壤物理性和结构，增加土壤胶体的数量与品质，提高土壤保肥供肥能力方面有很大效果。

　　此外，在有机质分解过程中还可以使水田土壤部分迟效性磷、钾活化，并产生各种促进水稻生长的生理活性物质和维生素B和生长素。促使土壤微生物繁衍，提高化学肥料的利用率。施用有机肥后，有机质腐解能为土壤微生物的生命活动提供所需要的能量和养料;反过来，微生物活动加速了有机质的分解，可以改良土壤结构，增加土壤有机质的含量，丰富土壤养分，提高土壤肥力。有机肥在分解的过程中，能放出大量二氧化碳，并产生有机酸等物质。由于二氧化碳浓度的提高，进一步满足了作物光合作用的需要。产生的有机酸，又能使土壤中原来难溶性的无机矿物盐类和难溶性肥料加速转化，变为能被作物吸收的营养，提高了土壤中原有养分的有效性。土壤对有机肥中磷的固定较小，而且有机肥中的磷50%~60%是水溶性或柠檬酸溶性的，可与化学肥料中的磷互相溶解，加速吸收。

　　长期的生产实践证明，土壤肥力与作物产量有着密切的关系。高肥力土壤上的作物光能利用率，比低肥力土壤高15~30倍;高肥力土壤上种植的作物比低肥力土壤早熟5~10天;高肥力土壤上作物产量可较低肥力土壤高50%~100%。所以大量增施有机肥料，保持和提高土壤肥力，对提高粮食产量和降低生产成本，具有极其重要的作用。