在水稻的种植中，青苔不仅与水稻争肥，而且妨碍稻田的通风透光、降低水温和泥温，影响秧苗和水稻的生长发育，导致减产。防治青苔通常采取以下土办法：一是排水晒田，让青苔脱水枯死。也可在中耕时用手将青苔塞入泥中，使它得不到阳光，青苔不能进行光合作用而死亡。二是在青苔上撒一层草木灰，因草木灰含碱，能导致青苔死亡。也可撒施茶枯粉，以提高稻田的碱性，使适宜酸性环境的青苔无法生长。还可将鲜枫树叶、苦楝叶、松针捣碎，连汁带渣施于田间，保持2-3厘米水层，让树叶浸出的碱性物质杀死青苔。也可采用化学药剂防除，效果也较好。适合防除稻田青苔的农药有：
　　(一)、硫酸铜。用硫酸铜50克，加水30千克喷雾。或用硫酸铜200-300克，装入纱布袋内，放在进水口处，使硫酸铜溶化后随灌溉水进入稻田，杀灭青苔。
　　(二)、青苔净。该药含三苯基乙酸锡和硫酸铜各10%，每667平方米用量为30克，加水30-35千克喷施。
　　(三)、稻思达。用80%稻思达水分散粒剂或可湿性粉剂6克，拌过筛细土20-30千克，均匀撒施。施药时田间保持3-5厘米水层，施药后至少保水5天。稻思达不仅能有效防除青苔，还能防除一年生禾本科、莎草科及阔叶杂草。
　　(四)、百螺敌 (45%三苯基乙酸锡可湿性粉剂)。每667平方米用百螺敌32-35克，拌过筛细土20-30千克均匀撒施。百螺敌不仅能防除青苔，还能防治福寿螺、稻曲病、稻瘟病。
　　(五)、丁草胺。每667平方米用60%丁草胺乳剂100毫升加水3-4千克，喷洒在20-30千克细干土中，拌匀堆闷2-3小时后撒施。丁草胺除能有效防除青苔外，还能防除稗草、千斤子、异型莎草、鸭舌草等稻田杂草。