水稻柱香病主要为害穗部。受害水稻抽穗前，病在颖壳内长成米粒状子实体，将花蕊包埋在内，壳内子实体从内外颖的合缝延至壳外，形状不一，外壳渐变黑，同时还有菌丝将小穗缠绕，使小穗不能散开，抽出的病直立圆柱状，故称“一柱香”。病穗初淡蓝色，后变白色，上生黑色粒状物，妈病原菌的子座。
　　病原 Ephelis oryzae H.Syd.称稻柱香菌，属半知菌亚门真菌。分生孢子座散生，黑色，浅杯形或突出，圆形，大小1-1.5mm，表面生分生孢子层;分生孢子梗分枝，无色，大小57-85×1-1.43(μm);分生孢子顶生，单或群生，无色针形，无隔，直或微弯，大小12-22×1-1.5(μm)。菌丝生长适温28℃，低于8℃，高于34℃不能生长，孢子在18-30℃间可发芽，26℃最适。孢子抗逆性强。
　　传播途径和发病条件 病菌以孢子座混入种子中越冬，种子带菌是发病主要原因。土壤无传病作用。该病是系统侵染性病害，带菌种子播种后，病菌从幼芽侵入，造成当年发病。
　　防治方法 (1)加强检疫，防止带菌种子进入无病区，从无病区引种。92)无病田留种。(3)种子处理。采用盐水选种或泥水选种汰除孢子座，或用52-54℃温汤浸种10分钟杀死种子上的病菌。