烟草根黑腐病主要发生于烟株根系上，使根呈特异性的黑色腐烂，从幼苗至成株期均可发病。苗染病引起“猝倒”，但根部发黑，别于猝倒病。病菌从根茎部侵入，病斑环绕茎部一周，向上侵至于叶，下侵至侧根，使整株幼苗枯死。较大烟株染病侧根根尖变黑，病株生长迟缓，植株矮小，叶色黄褐。重病株拔起可见整株根系变黑褐、坏死。气候炎热时，白天病株萎蔫，夜间恢复正常，病株叶片变黄、变薄，严重影响烟草产量和质量。
　　防治措施：
　　(1)选栽抗病品种 目前推广的有Nc2、Nc88、Nc89、Nc95、Nc98、日本的山阳1号、远州1号、美国的马里兰609、Burleyl、Burley2等，白肋烟有建白80、8701、8301、B37、白肋11A、11B、2lB、37B、49B等。
　　(2)实行轮作 与禾本科作物实行3年以上轮作，避免与豆科、蔬菜作物连作。
　　(3)加强栽培管理，育苗时选用无病苗床，不施带病菌有机肥。注意田间排湿，及时中耕松土。
　　(4)药剂防治 用10g/m2的50%甲基托布津或50%苯来特可湿性粉剂消毒床土。栽植时用以上药剂50g/667m2拌土后穴施。发病初期，浇灌50%甲基硫菌灵可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂600一800倍液、50%福美双可湿性粉剂500倍液，每株灌对好的药液l00一200ml。