甘蔗叶萎病病菌以枯死病叶上的子囊壳及分生孢子越冬，遇水释放出子囊孢子或分生孢子，借气流传播侵害健株。分生孢子是本病主要侵染源，萌芽后从气孔侵入，为害期约14天。多雨地区发病重。
　　主要为害叶片和叶鞘。叶片染病 初生浅红色小斑点，后小斑点沿叶脉向两端扩展，形成纺锤形斑，中央常生红褐色侵入小点。蔗种不同病斑颜色有红、黄、黄褐、红褐色等多种。病斑长3～10mm，宽2～4mm，有时条纹融合成带状，带中常有一狭窄的绿条间隔。发病重的，病叶吴红褐色枯死。后期病斑边缘出现黑色小点，即病原菌的子囊座。叶鞘染病 亦产生紫红色病斑。
　　防治方法 (1)选用抗病品种。(2)雨后及时排水，防止湿气滞留。(3)发病初期开始喷洒50%苯菌灵可湿性粉剂1000～1200倍液或36%甲基硫菌灵悬浮剂600倍液。