西葫芦菌核病南方2-4月及11-12月发病，北方3-5月发生多。本菌对水分要求较高;相对湿度高于85%，温度在15-20℃利于菌核萌发和菌丝生长、侵入及子囊盘产生。因此，低温、湿度大或多雨的早春或晚秋有利于该病发生和流行，菌核形成时间短，数量多。连年种植葫芦科、茄科及十字花科蔬菜的田块、排水不良的低洼地或偏施氮肥或霜害、冻害条件下发病重。此外，定植期对发病有一定影响。
　　【症状特征】：主要为害果实及茎蔓。果实染病，残花部先呈水浸状腐烂，后长出白色菌丝，菌丝上散生鼠粪状黑色菌核。茎蔓染病，初呈水浸状，病部变褐，后也长出白色菌丝和黑色菌核，病部以上叶、茎蔓枯死。
　　【防治措施】：防治方法以生态防治为主，辅之以药剂防治，可以控制该病流行。(1)农业防治。有条件的实行与水生作物轮作，或夏季把病田灌水浸泡半个月，或收获后及时深翻，深度要求达到20厘米，将菌核埋入深层，抑制子囊盘出土。同时采用配方施肥技术，增强寄主抗病力。(2)物理防治：播前用10%盐水漂种2-3次，汰除菌核，或塑料棚采用紫外线塑料膜，可抑制子囊盘及子囊孢子形成。也可采用高畦覆盖地膜抑制子囊盘出土释放子囊抱子，减少菌源。(3)种子和土壤消毒。定植前用40%五氯硝基苯配成药土耙入土中，亩用药1公斤对细土20公斤拌匀;种子用50℃温水浸种10分钟，即可杀死菌核。(4)生态防治。棚室上午以闷棚提温为主，下午及时放风排湿，发病后可适当提高夜温以减少结露，早春日均温控制在29℃高温，相对湿度低于65%可减少发病，防止浇水过量，土壤湿度大时，适当延长浇水间隔期。